Ученые разработали простой метод модификации пептидов для расширения возможностей поиска лекарств
Исследователи из Университета Бирмингема, в сотрудничестве с Университетами Бристоля и Лидса, открыли новый метод модификации пептидов, который может значительно расширить возможности диагностики заболеваний и поиска новых лекарств.
Традиционно целями в поиске лекарств являются ферменты, такие как протеазы и киназы. Эти белки привлекают внимание исследователей благодаря наличию четко определенных "сайтов связывания" для их субстратов — молекул, с которыми взаимодействуют ферменты. Создание молекул, имитирующих субстрат и способных ингибировать или модифицировать функцию целевого фермента, стало относительно простой задачей.
Однако большинство биологических функций регулируются взаимодействиями между белками (PPIs), а не только активностью ферментов. PPIs гораздо многочисленнее традиционных целей для поиска лекарств, что делает их блокирование перспективным для разработки новых терапевтических препаратов.
До недавнего времени PPIs считались слишком сложными для использования в качестве целей для лекарств из-за их крупных сайтов связывания, которые не имеют глубоких карманов или борозд, к которым могут присоединяться малые молекулы. Понимание механизмов PPIs и способов их контроля является важным шагом к разработке новых лекарств.
В новом исследовании, опубликованном в журнале Chemical Science, команда сосредоточилась на PPI, включающем формирование β-нитей на интерфейсе взаимодействия. β-нить — это специфический тип вторичной структуры, которая формирует трехмерную структуру белков. Исследователи взяли небольшую последовательность пептида из части белка, где формируется β-нить, и внесли изменения в ее основу, что позволило добиться более быстрого и прочного связывания с целью.
«Наша модификация использует относительно простую химию и дала нам понимание того, как пептиды связываются со своими целями в β-нитевой конформации и как контролировать это связывание,» — сказал ведущий исследователь профессор Энди Вилсон. «Это открывает путь к поиску лекарств для целей, связанных с β-нитевыми PPIs.»
Команда показала, как этот метод может быть применен к одному конкретному типу PPI — взаимодействию SIM/SUMO, которое играет фундаментальную роль в стабильности белков, ответе на стресс и клеточном цикле. Следующим шагом будет демонстрация возможности обобщения подхода для различных PPIs.
Исследование проводилось группой Вилсона в Университете Бирмингема и финансировалось за счет программных грантов EPSRC и стратегических наград BBSRC sLoLa.
Источник: https://www.sciencedaily.com/releases/2024/06/240607121440.htm
Авторизуйтесь, чтобы оставить комментарий.